La Gp120 est aussi liée avec un anticorps
neutralisant (induit) (17b).
Cette structure montre la partie extracellulaire
de la gp120 (bleu foncé) du HIV liée à la partie extracellulaire
de l'antigène CD4 (bleu clair) située à la surface
d'un lymphocyte T ou d'un macrophage. Est également présent
un anticorps neutralisant la gp120 du HIV (chaine légère
en vert foncé et chaine lourde en vert clair). Les chaînes
d'anticorps peuvent être masquées avec ces boutons :
Masquer la chaîne lourde
Masquer la chaîne légère
Chaîne lourde en "fil de fer"
Chaîne légère en"fil de fer"
Vous pouvez faire tourner la molécule avec la souris (bouton gauche enfoncé) ou en utilisant les boutons situés au bas de cette page...
Interactions entre molécule Gp120
et antigène CD4 :
L'antigène CD4 situé à la
surface de la cellule et la gp120 du virus interagissent au niveau d'une
dépression dans la molécule de gp120 dépourvue de
chaînes carbonées (montrer les chaines carbonées
en "space fill" ).
Les contacts directs entre les deux protéines impliquent 22 acides
aminés du CD4 et 26 acides aminés de la gp120 mais les résidus
qui sont les plus importants dans cette association sont trp 427, glu 370,
gly 473 et ile 371 of gp120 (choisissez "spacefill"
rouge: )
qui interagissent avec phe 43 of CD4 (choisissez "spacefill"
jaune : )
et val 430 of gp120 (choisissez "spacefill" rouge : )
qui interagit avec arg 59 of CD4 (choisissez "spacefill"
en jaune : ).
Faites un zoom sur cette zone (revenir
à la taille d'origine:).
Vous pouvez aussi afficher les acides aminés et les chaines carbonées
en mode "space-fill" à l'aide des boutons situés à
la droite de la molécule.
Interactions entre Gp120 et récepteur
de chimiokines (molécules permettant le recrutement des
cellules immunitaires) :
En plus de son interaction avec l'antigène
CD4 à la surface des lymphocytes T4, la gp120 peut aussi réagir
avec un co-récepteur. Il existe de très nombreux récepteurs
de chimiokines capables de réagir avec la gp120. Le site de liaison
pour la chimiokine apparaît après la liaison avec l'antigène
CD4. Ce site recouvre en partie la chaine lourde de l'anticorps sur cette
image (Représenter la chaine
lourde en "space fill" ).
Les
résidus de la gp120 impliqués dans cette liaison sont lys121,
arg419, lys 421 et gln422 (Activer "space fill" magenta ).
Notez également que cette interaction a lieu une fois de plus dans
une région dépourvues de chaines carbonées (Activer
"space fill").
Vous pouvez aussi sélectionner le mode "space-fill" pour chaque
acide aminé en uilisant les boutons ci-dessous.
Pour effectuer d'autres modifications : utilisez
le clic droit sur la molécule pour faire apparaître le menu
"Chime".
Informations sur la base de données PDB
: ici
Pour obtenir CHIME : ici
|
(bleu foncé) Backbone
Space Fill Ribbons Strands |
Antigène
CD4
(à la surface des cellules) (vert initialement, puis bleu clair) Backbone
Space Fill Ribbons Strands |
|
| Anticorps
(chaîne lourde)
(orange) Backbone Space Fill Ribbons Strands Off |
Anticorps
(chaîne légère)
(green) Backbone Space Fill Ribbons Strands Off |
|
| Chimiokine
(CCR5) attachée à la
Gp120 du HIV (magenta) lys121 Space Fill
arg419 Space Fill lys 421 Space Fill gln422 Space Fill Désactiver le mode
|
Interactions hydrophobes entre
CD4 cellulaire et gp120 virale
* Composants de la Gp120
:
Turn Space Fill off * Composants de l'antigène
CD4 :
|
|
| Vous
pouvez aussi observer la structure de la molécule de gp120 avec
plus de détails en vous rendant ICI
Consulter la page originale (en anglais) :
|
Zoom annulé
Zoom 200% Zoom 300% |
Rotation active
Vous pouvez aussi faire tourner
la molécule avec la souris (bouton gauche enfoncé)Rotation désactivée |
© Richard Hunt, University of South Carolina School of Medicine - traduction J-P. Chouzenoux.