Pour visualiser les molécules présentées il faut utilise
le "plugin" Chime distribué gratuitement par MDL.
Une inscription sur le site MDL est necessaire, il faut ensuite télécharger
le plugin puis l'installer.
Plus simplement, plusieurs version sont aussi disponibles en téléchargement sur
le site de l'INRP : version2.6SP7 (nov 2007)
ou d'autres versions plus anciennes :version2.6SP4 (oct 2002) version2.6SP5 (dec 2003) version2.6SP6 (mars 2004)
Aprés téléchargement il faut installer le "plugin".
Pour utilisation avec Firefox il faut :
- Installer normalement le pluging sous Internet Explorer ;
- Copier les fichiers "chime" du dossier "plugins" de IE
(Program files/Internet Explorer/Plugins) dans le dossier "plugins"
de Firefox (Program fileS/Mozilla Firefox/Plugins)
Si les molécules ne s'affichent pas après redémarrage du système il faut essayer de diminuer le niveau de sécurité pour autoriser l'exécution des scripts permettant l'affichage et la manipulation des molécules.
- Le cliquer-glisser permet de faire tourner la molécule ;
- Les touches Maj + souris permettent un Zoom ;
- Les touches Ctrl + bouton droit permettent de déplacer la sélection
;
- Un clic du bouton droit sur la molécule ouvre un menu contextuel qui
permet de faire tourner la molécule, de choisir la représentation
(modèle compact, éclaté, fil de fer...).
Pour construire des molécules qui peuvent ensuite être visualisées
avec le plugin dans un navigateur Internet, on peut, par exemple utiliser Chemstekch
que l'on peut télécharger sur le site de acdlabs.
Il faut ensuite exporter ces molécules dans un format convenable : ".mol".
On peut ensuite utiliser "Molda" pour les convertir en ".pdb" (seul format accepté par certains navigateurs).