Celle ci-dessus composée de un atome de carbone en noir et de deux atomes d'oxygène en rouge a les centres de chaque atome alignés suivant une droite.Elle est dite linéaire et correspond au gaz carbonique CO2.Par contre la molécule d'eau H2O est plane , les centres des atomes sont trois points formant nécessairement un plan .

Au-delà de trois atomes les centres ne sont plus nécessairement dans un même plan ,c'est le cas de l'ammoniac NH3 formant une pyramide à faible hauteur à gauche et du méthane CH4 formant un tétraèdre régulier à droite .

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Pourtant des molècules de chimie organique comportant un grand nombre d'atomes peuvent rester planes , c'est le cas du benzène C6H6 en raison des orbitales particulières des électrons appartenant au noyau benzènique .

La complexité des molécules de la chimie organique s'accroît avec le nombre de leurs atomes constituants , ainsi les molécules d'acides nucléiques et pour l'exemple la double hélice de l' A.D.N (acide désoxyribonucléique) ci-dessous .